单体预测只看一条链
单链模型适合观察结构域和局部折叠，但无法自动说明真实寡聚状态。
实验中的蛋白可能与其他链、核酸或小分子共同工作。
复合体需要明确成员
多聚体预测需要正确的链组成与比例。错误成员也可能生成视觉上合理的界面。
已知互作证据应与预测结果分开记录。
无序不是计算失败
一些区域在生理状态下本来就缺少稳定构象。
低置信度可能提示无序，也可能来自资料不足，需要结合序列与实验判断。
动态状态不会停在一张图
蛋白可以在多个构象之间转换。单一预测通常只提供有限的状态线索。
不要把静态图当成完整运动过程。
结果文件要保留条件
输入链、模型版本、置信度和运行参数应与结构文件同时保存。
只保存渲染图片会失去复核能力。